Il y a 25 ans, Twin Peaks, petite ville pittoresque du nord-ouest des Etats-Unis, était le théâtre d'un crime qui avait bouleversé ses habitants, stupéfaits d'apprendre la mort de la «reine du lycée», sauvagement assassinée, découverte dans une bâche en plastique. Dépêché sur place, l'agent fédéral Dale Cooper, en proie aux ombres enveloppant la ville et sa forêt, tentait de résoudre l'énigme. Vingt-cinq ans plus tard, Dale Cooper est toujours hanté par cette affaire qui l'avait conduit au bord de la folie. A New York, un jeune homme observe une mystérieuse boîte en verre. Dans le Dakota du Sud, un policier enquête sur un crime et reçoit un message à propos de Dale Cooper...